CUT&Tag：蛋白質-DNA互作研究技術，鑒定表觀基因組修飾圖譜
技術介紹
Cleavage Under Target & Tagmentation (CUT&Tag) 是近年來新興的一種染色質DNA結合圖譜測序研究方法。該方法通過Protein A/G融合的Tn5轉座酶與抗體結合，使Tn5轉座酶被募集在靶標位點附近，從而在靶標位點引發DNA轉座反應，在將染色質DNA切斷的同時，引入二代測序所需的接頭序列。CUT&Tag技術相比於經典的ChIP-seq技術，具有不需要超聲打斷，信噪比高，所需細胞量少的優勢。此外，相比於另一種新技術Cleavage Under Target And Release Using Nuclease (CUT&RUN)，CUT&Tag不需要傳統的連接法添加測序接頭，操作簡單、實驗周期更短。因此，CUT&Tag在組蛋白修飾、轉錄因子的染色質結合狀態的研究中得到了廣泛的應用。
特大福利
表觀生物CUT&Tag技術服務
免費提供多種組蛋白修飾抗體
以及轉錄因子抗體
歡迎谘詢！
技術應用
H3K27ac：繪製增強子圖譜，鑒定超級增強子目錄
H3K4me3：檢測轉錄起始位點附近激活的啟動子區域
組蛋白乳酸化修飾：在基因啟動子上高度富集，與Warburg效應相關的血管生成、缺氧、巨噬細胞極化過程相關基因的活躍表達有關。
組蛋白巴豆酰化修飾：與活躍轉錄和基因激活密切相關，調控著基因表達及配子成熟等生物學過程。此外，組蛋白巴豆酰化修飾的蛋白參與了RNA剪接、蛋白質合成降解、DNA複製和修複、內吞作用、細胞間連接等多種生物學過程。
DNA G4鏈體：通常位於基因啟動子區域、5'非翻譯區和染色體端粒，能夠影響這些區域的DNA複製、轉錄和穩定性。例如，G4結構的形成可以作為一種調節機製，通過阻礙或促進轉錄因子的結合來調節特定基因的表達，與多種疾病的發展有關，如癌症、神經退行性疾病等。
更多轉錄因子：挖掘蛋白質-DNA相互作用
技術優勢
1. 樣本量僅需20萬個細胞
2. 操作便捷，一管完成所有步驟
3. 信噪比高（背景低），重複性好
圖1. CUT&Tag技術原理圖
技術原理
將特異的抗體（如H3K27ac）與染色質蛋白原位結合，然後錨定到A-Tn5轉座融合蛋白。Tn5轉座酶活性被激活，僅將抗體靶蛋白結合的染色質片段化，高效產生高分辨率、低背景的片段文庫。
圖2. IGV峰圖
表觀生物實測數據
圖3. CUT&Tag文庫質控圖
![圖4. 表觀生物利用CUT&Tag檢測組蛋白修飾H3K27me3的讀長覆蓋圖，顯示CUT&Tag H3K27me3 peaks（第二行），與文獻數據對比（第一行）[1]](http://openapi.whaleng.com/file-server/ep/2024/06/01ac71642a334d74b46eb8df6a1ba376.png)
圖4. 表觀生物利用CUT&Tag檢測組蛋白修飾H3K27me3的讀長覆蓋圖，顯示CUT&Tag H3K27me3 peaks（第二行），與文獻數據對比（第一行）[1]
圖5. 表觀生物利用CUT&Tag檢測H3K27me3的TSS分布熱圖（左列），與文獻數據對比（右列）[1]
圖6. 普通增強子與超級增強子鑒定分析
圖7. 普通增強子與超級增強子信號富集圖
圖8. 超級增強子鑒定及數量分析圖繪製
圖9. 超級增強子結合轉錄因子預測
圖10. 核心轉錄因子調控回路（CRC）
圖11. 熱圖顯示H3K9la CUT&Tag測序信號在TBD0220TR細胞有明顯的富集
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圖15. ChIP-seq結果顯示H3K27ac與 XBP1基因的結合位點
參考文獻
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